Στο κέντρο της πόλης του Ηρακλείου, στην οδό 25ης Αυγούστου, βρίσκεται ένα άλλο σημαντικό ιστορικό μνημείο – ο καθεδρικός ναός του Αγίου Τίτου. Το όνομά του ο ναός πήρε προς τιμήν του πολιούχου αγίου Τίτου, που σε Ι αιώνα μ. χ. κήρυξε στο νησί ο χριστιανισμός. Ο άγιος Τίτος ήταν μαθητής του αποστόλου Παύλου και πρώτος επίσκοπος Κρήτης.

Σε 961 χρονιά ο αυτοκράτορας Νικηφόρος Foca έφερε τους άραβες από την Κρήτη, με αποτέλεσμα το νησί βρέθηκε και πάλι κάτω από το φτερό ισχυρή Βυζαντινή αυτοκρατορία. Τότε χτίστηκε ο καθεδρικός ναός του Αγίου Τίτου, να αναβιώσει την χριστιανική πίστη και τις παραδόσεις της Κρήτης, ήρθε σε παρακμή μετά την κατάκτηση του νησιού από τους μουσουλμάνους. Την πρώτη εκκλησία, αφιερωμένη στον Αγ.Τίτο, ήταν στην αρχαία πόλη Γόρτυνα (Гортис), η οποία ήταν η πρώτη πρωτεύουσα της Κρήτης, της ρωμαϊκής εποχής, αλλά καταστράφηκε από σεισμό. Η πρωτεύουσα του νησιού έχει μεταφραστεί σε Кандию (Ηράκλειο), ενώ τα κειμήλια του παλαιού ναού (τα λείψανα του Αγίου Τίτου, τη θαυματουργή εικόνα της Παναγίας, κλπ.), μεταφέρθηκαν στο νέο μοναστήρι.

Στη βυζαντινή περίοδο η εκκλησία ήταν η έδρα του ορθόδοξου αρχιεπισκόπου Κρήτης (κατά την εποχή της αραβικής κυριαρχίας εδώ επίσης βρισκόταν χριστιανικό ναό). Όταν венецианцах ίδιο το κτίριο βρίσκεται ο καθεδρικός ναός του καθολικού αρχιεπισκόπου. Σε μια περίοδο, όταν στην Κρήτη επικρατούσε ανάμεσα στους τούρκους, η εκκλησία ήταν переоборудована σε τζαμί. Όλα τα κύρια λείψανα του καθεδρικού ελήφθησαν στη Βενετία τον στρατηγό Μorozini λίγο πριν από την εισβολή των τούρκων στην πόλη.

Ένας μεγάλος σεισμός του 1856 κατέστρεψε ολοσχερώς το κτίριο. Το 1872 ο ναός έχει ανακατασκευαστεί σε παλιά θεμέλια υπό την καθοδήγηση της οθωμανικής αρχιτέκτονα Αθανασίου Моусисса. Στη δεκαετία του 1920, όταν τα τελευταία μουσουλμάνοι έφυγαν από το Ηράκλειο, η εκκλησία και πάλι σημαδευτεί ως ορθόδοξος ναός. Στη συνέχεια, πραγματοποιήθηκε η ανακαίνιση της εκκλησίας και μιναρές αντικατασταθεί στο καμπαναριό. Το 1956, τα λείψανα του Αγίου Τίτου έχουν επιστραφεί στο Ηράκλειο και σήμερα φυλάσσονται στον καθεδρικό ναό του Αγίου Τίτου.