Το αρχαιολογικό μουσείο στην πόλη του Ηρακλείου στο νησί της Κρήτης είναι ένα από τα μεγαλύτερα μουσεία της Ελλάδας και το καλύτερο μουσείο της μινωικής τέχνης στον κόσμο. Η έκθεση του μουσείου παρουσιάζει την πιο εμφανή και μια ολοκληρωμένη συλλογή από εκθέματα του μινωικού πολιτισμού της Κρήτης. Στο μουσείο παρουσιάζονται και άλλες περιόδους της ιστορίας της Κρήτης (από τη νεολιθική μέχρι την ελληνο-ρωμαϊκή περίοδο), αλλά και αντικείμενα της μινωικής περιόδου αποτελούν τη βάση της έκθεσης.

Η πρώτη αρχαιολογική συλλογή της πόλης του Ηρακλείου, ακουμπάει αρχή σύγχρονο μουσείο, που ιδρύθηκε το 1883, υπό την καθοδήγηση του αρχαιολόγου Ιωσήφ του μάνου χατζηδάκη και ήταν μια μικρή συλλογή αρχαιοτήτων. Σε 1904-1912 χρόνια για το μουσείο χτίστηκε ξεχωριστό κτίριο, αλλά από τρεις καταστροφικούς σεισμούς του 1926, το 1930, το 1935 χρόνια το κτίριο έχει σχεδόν καταστραφεί. Ο διευθυντής του μουσείου Спиридон Маринатос κατέβαλε τεράστια προσπάθεια για να βρει κεφάλαια και να πείσει τους κατοίκους και αρχές στην ανάγκη κατασκευής νέου κτιρίου. Η κατασκευή του ξεκίνησε το 1937 υπό την καθοδήγηση του έλληνα αρχιτέκτονα Патроколоса Карантиноса στη θέση του κατεστραμμένου από το σεισμό (1856) του καθολικού της μονής του Αγίου Φραγκίσκου. Κατά τη διάρκεια του β ' παγκοσμίου πολέμου το μουσείο ήταν πολύ κατεστραμμένο, αλλά μια συλλογή από αρχαιότητες κατάφερε να κρατήσει και το 1952 ήταν και πάλι έγινε διαθέσιμη για τους επισκέπτες. Το 1964 στο κτίριο ήταν συνδέσει αυτό μια άλλη πτέρυγα.

Η έκθεση του μουσείου περιλαμβάνει μια μεγάλη ποικιλία από τα αντικείμενα: κεραμικά, ειδώλια, γλυπτά, κοσμήματα, όπλα και εργαλεία, οικιακά σκεύη, εκτύπωση, τελετουργικά αντικείμενα και πολλά άλλα. Ένα από τα κύρια αξιοθέατα του μουσείου θεωρείται μοναδικό περίφημος δίσκος της φαιστού, από τερακότα με την αρχαία εγχάρακτα, που μέχρι στιγμής δεν μεταγραφεί. Το μουσείο παρουσιάζει μια υπέροχη συλλογή από διάφορες τοιχογραφίες (1600-1400гг π.α.), η πιο διάσημη από τις οποίες είναι "ο Πρίγκιπας με τα κρίνα", "Parisienne" και "Παιχνίδια με τον ταύρο". Ξεχωριστή θέση στην έκθεση κατέχουν τα δύο θηλυκά фаянсовые ειδώλια, τα λεγόμενα "Θεάς των όφεων", που βρέθηκαν κατά τις ανασκαφές στο 1903 και χρονολογούνται από το 1600 g. π.α. Ένα αριστούργημα της μινωικής τέχνης του κοσμηματοπωλείο, είναι η αναστολή "Χρυσές μέλισσες", βρέθηκε στην κρητική πόλη Маллии. Ενδιαφέρον επίσης παρουσιάζουν δύο όψεις χάλκινο τελετουργικό τσεκούρι "Λεπίδα Аркалохори" (1500-1450 gg. π.α.) και χάλκινο μαχαίρι με χρυσή эфесом (1800-1700 gg. π.α.).

Το νοέμβριο του 2006, το κτίριο του μουσείου έχει κουμπώσει στην αποκατάσταση. Τα πιο πολύτιμα έργα τέχνης εκτέθηκαν σε ειδικά σχεδιασμένες παράρτημα (προσωρινή έκθεση). Τον αύγουστο του 2012 μετά από μια μεγάλη ανακαίνιση το μουσείο άνοιξε για τους επισκέπτες.