Η ιδέα για τη δημιουργία Αρχαιολογικού μουσείου στην πόλη: Αλμερία προέρχεται ακόμα στο πρώτο μισό του 19 αιώνα. Το 1837 από το κοντινότερο στην πόλη και τα περίχωρά της τα μοναστήρια κατάφερε να αποσύρει 196 σχεδίων, καθώς και αρχαία νομίσματα και επιτύμβιες στήλες, κοσμήματα και σκεύη, που σχετίζονται με την περίοδο της αραβικής κυριαρχίας στην επικράτεια της Ισπανίας. Αλλά για κάποιους άγνωστους λόγους το άνοιγμα του μουσείου σε εκείνη την περίοδο και έτσι δεν πραγματοποιήθηκε. Στη συνέχεια, μεγάλο μέρος αυτών των αντικειμένων ανήλθε σε συλλογές μουσείων έξω από την Αλμερία και ακόμη και στο εξωτερικό.

Διακήρυξη Δεύτερη Ισπανική Δημοκρατία ήταν το γεγονός ότι το 1933 στην Αλμερία ήταν ακόμα ανοιχτό το Αρχαιολογικό μουσείο, το οποίο δημοσιεύτηκε στο κτίριο του ερευνητικού κέντρου. Η αρχική συλλογή του μουσείου ανήλθε σε αρχαιολογικούς χώρους, βρέθηκαν κατά τις ανασκαφές στην Αλμερία και την γύρω περιοχή. Το 1934, το μουσείο έχει ήδη ξεκινήσει συνεργασία με άλλους музейными ταμείων της χώρας. Το 1979 σε σχέση με την επέκταση των συλλογών μουσείο μεταφέρθηκε στο κτίριο, στο οποίο στεγάζεται το κολέγιο Της Παναγίας del Mar.

Το 1998 για το έργο τους αρχιτέκτονες Ignacio Garcia Pedrosa και η Άντζελα Garcia de Paredes χτίστηκε νέο κτίριο του μουσείου, που ανταποκρίνεται στις σύγχρονες απαιτήσεις. Οι εσωτερικοί χώροι του νέου σώματος, ευρύχωρα και φωτεινά με τη χρήση προσεκτικά μελετημένο σύστημα φυσικού φωτισμού, διαθέτουν μινιμαλιστικό σχεδιασμό, καθαρές γεωμετρικές γραμμές και την αντίληψη του όγκου. Συλλογή του Αρχαιολογικού μουσείου της Αλμερία παρουσιάζονται εκθέματα που κυμαίνονται από την παλαιολιθική περίοδο και πριν από την περίοδο κυριαρχία των μαυριτανών στην Ιβηρική χερσόνησο.