Μια αρχαία παράδοση λέει ότι σε 1364 έτος λιθουανικά ευγενής με το όνομα Гоштаутас, προσκάλεσε στη χώρα 14 францисканских τους μοναχούς και τους χάρισε το σπίτι, ώστε να μπορούν να εγκατασταθούν στη χώρα. Όταν Гоштаутаса έφυγε, όλοι οι μοναχοί σκοτώθηκαν. Λίγο αργότερα, ευγενής κάλεσε άλλους μοναχούς των φραγκισκανών. Νέων μοναχών αυτός πήγε αλλού, και στη θέση νεκρά μοναχούς έχτισε μια εκκλησία, που ονομάστηκε προς τιμήν του τιμίου Σταυρού.

Το 1524 η εκκλησία κάηκε. Στο 1635 χρόνο σε αυτό το μέρος εγκαταστάθηκαν οι ιερείς бонифратры. Άρχισαν τη λειτουργία του με ό, τι χτίστηκε μια νέα εκκλησία του Αγίου Σταυρού, ιδρύθηκε κοντά στην ομώνυμη μονή και άρχισαν στο χώρο του μοναστηριού νοσοκομείο. Αργότερα νοσοκομείο μετατραπεί σε ένα άσυλο για παράφρονες. Εκκλησία Гоштаутаса είχε παραχωρηθεί υπό μοναστική δωμάτιο. Ψυχιατρικό νοσοκομείο λειτουργεί εδώ μέχρι το 1903, όταν μεταφράστηκε σε νέα κτίρια, που κατασκευάστηκαν ειδικά για ένα ψυχιατρικό νοσοκομείο.

Το 1737 έτος εκκλησία πάλι γκάζι. Το 1748 εκκλησία ανακαινίστηκε, ήταν εντελώς ремонтирован εσωτερικό, φτιαγμένοι έξι βωμούς, και εγκαταστάθηκε костельная τμήμα, χτισμένο σε στυλ μπαρόκ. Επίσης, σε στυλ μπαρόκ διακόσμηση πρόσοψη και το ίδιο το κτίριο της μονής. Αν και μετά από αυτή την αποκατάσταση στο εξωτερικό του κτιρίου υπήρχαν και στοιχεία ροκοκό. Στο εσωτερικό του ναού μεγαλοπρεπώς πάνω από το ευρύχωρο δωμάτιο πέτρινα, εγκάρσιες καμάρες. Ενδιαφέρον συνδυασμός αρχιτεκτονικά στοιχεία μπαρόκ, ροκοκό και неорококо.

Στο χώρο του ναού βρίσκεται η πηγή, θεωρούμενο ως η μαγική συνταγή. Οι θρύλοι λένε ότι η πηγή εμφανίστηκε ξαφνικά κοντά σε άγαλμα του Ευαγγελισμού της θεοτόκου. Αυτό είναι το μέρος, όπου υφίστανται βασανιστήρια убиенные οι μοναχοί φραγκισκανοί. Λένε ότι είναι ιδιαίτερα ευεργετική επίδραση νερό αυτής της πηγής σε ασθενείς, πάσχουν από οφθαλμικές παθήσεις.

Στην εκκλησία υπάρχει και θαυματουργό σταυρό, που έχει εγκατασταθεί πάνω από το κύριο βωμό. Κάτω από το σταυρό βρίσκεται η εικόνα Της Παναγίας με το βρέφος. Προφανώς, η εικόνα αγιογραφήθηκε τον 17ο αιώνα, αλλά доподлинное προέλευση σχεδίων άγνωστο. Κι αυτή προστέθηκε στην θαυματουργή δημιουργήματα. Αντίγραφο θαυματουργή εικόνα Της Παναγίας με το βρέφος, σε μορφή τοιχογραφίες, μπορείτε να δείτε και στην αρχική πρόσοψη Костела. Βρίσκεται κάτω από την τοξωτή αέτωμα, που χρονολογείται από το 1737 έτος μεταξύ δύο πλευρικούς πύργους костела.

Μεταξύ 1914 και το 1924 χρόνια στο ναό έχουν διεξαχθεί ειδικές υπηρεσίες για τους μαθητές λιθουανίας σχολεία. Σε μια περίοδο, όταν Βίλνιους κατελήφθη από την Πολωνία, στο ναό δεν έχουν διεξαχθεί υπηρεσιών στη λιθουανική γλώσσα.Το 1843 το Τάγμα бонифратров ήταν καταργήθηκε και στη θέση του μοναστηριού έμεινε μόνο τους εκπροσώπηση. Το 1909 η εκκλησία ήταν και πάλι ремонтирован. Στο τέλος του Πρώτου παγκοσμίου πολέμου, το 1924, ο επίσκοπος Юргис Матулайтис κάλεσε бонифратров να επιστρέψει στο μοναστήρι του τιμίου Σταυρού. Επιστροφή των μοναχών στο μοναστήρι ήταν πολύ своевременен. Έχουν επισκευαστεί εκκλησία, воздвигнув σε έξι βωμούς. Επίσης έκαναν κατά της ιεράς μονής καταφύγιο για τους ηλικιωμένους και συσσίτιο για τους άπορους "Caritas".

Στην αρχή του β ' παγκοσμίου πολέμου οι αδελφοί από Вильны αποσύρθηκαν τάγμα бонифратров. Το 1947 το μοναστήρι προφύλαξε τις αδελφές της συνόδου "Ευαγγελισμού της θεοτόκου Της Παναγίας". Ωστόσο, κυριαρχούσε είναι εδώ για πολύ καιρό. Οι σοβιετικές αρχές έκλεισαν το 1949 και το μοναστήρι και ο ναός. Σε κτίρια του μοναστηριού βρίσκονταν κατοικίες διαμέρισμα.

Το 1976 ο ναός отреставрировали και οργάνωσαν σε αυτό concert hall Вильнюсской φιλαρμονικής, η λεγόμενη "Μικρή αίθουσα του μπαρόκ". Εδώ διοργανώνονται συναυλίες όργανο μουσικής.

Вильнюсское архиепископство πήρε πίσω τα κτίρια μόνο μετά την αλλαγή της κρατικής οικοδόμησης, το 1990. Ο ναός και τα κτήρια της μονής έχουν αποκατασταθεί, αγιαστεί και να μεταφερθεί πρόσφατα στις αδελφές της συνόδου αδελφές "Ευαγγελισμού της θεοτόκου Της Παναγίας".