Η εκκλησία του Αγίου Θωμά είναι ένας από τους παλαιότερους ναούς της Λειψίας, η οποία είναι γνωστή χάρη στο γεγονός ότι το έτος 1539 σε αυτό το μνημειακό κτίριο κήρυξε ο Μάρτιν Λούθερ, ο "πατέρας" της Μεταρρύθμισης. Στο XVIII αιώνα, για πάνω από τριάντα χρόνια υπηρέτησε кантором τοπική χορωδία διάσημος γερμανός συνθέτης Γιόχαν Σεμπάστιαν Μπαχ. Εδώ βρίσκεται ο χρήστης - οι στάχτες του μεγάλου συνθέτη, μεταφέρθηκε εδώ το 1949 και θάφτηκε κάτω από ένα χάλκινο ταφόπλακα.

Ως αποτέλεσμα των προηγουμένως αρχαιολογικών ανασκαφών, διαπιστώθηκε ότι στο χώρο της εκκλησίας του Αγίου Θωμά προηγουμένως βρισκόταν ρωμανικός ναός, προκύπτουν ακόμα στον αιώνα XII. Μερικά από τα κομμάτια που παρουσιάζονται τμημάτων του ιδρύματος, χρονολογούνται από το έτος 1160 και αποθηκεύονται στο βωμό της εκκλησίας. Το 1355 το έτος αρχαίος ναός ξαναχτίστηκε ήδη σε γοτθικό στυλ.

Μετά την εκκλησία περίμενε μερικές ακόμα αναδιαρθρώσεις, αλλά με το τέλος του XV αιώνα και επί τετρακόσια χρόνια παρέμεινε αμετάβλητη, εκτός από ένα από τους πύργους, που ήταν ξαναχτίστηκε το 1702. Η στέγη του ναού έχει αρκετά απότομη γωνία κλίσης, φθάνοντας τα 63 βαθμούς, μεταξύ της εσωτερικής διακόσμησης, τίποτα δεν σώζεται από εσωτερική διακόσμηση σε στυλ μπαρόκ, με αποτέλεσμα την αναδιαμόρφωση του ΧΙΧ αιώνα ήταν αντικαθίσταται από неоготический διακόσμηση.

Μέσα στην εκκλησία του Αγίου Θωμά βρίσκεται μαρμάρινη κολυμβήθρα με εικόνες από διάφορες βιβλικές σκηνές, επί Францем Детебером. Στους τοίχους βωμό βρίσκονται vintage πορτρέτα ποιμένες της πόλης, οι παλαιότερες από τις οποίες χρονολογούνται από το έτος 1614. Σκαλιστά ξύλινη καρέκλα – ένα από τα λίγα πράγματα, που σώζεται από την εποχή της ζωής του Μπαχ. Στο ναό, επίσης, υπάρχουν επιτύμβιες στήλες της εποχής XV-XVI αιώνα, η παλαιότερη από αυτές ανήκει ιππότη Χέρμαν φον Харрасу.

Ως αποτέλεσμα του πολέμου του 40-ες του ΧΧ αιώνα, η εκκλησία του Αγίου Θωμά σχεδόν δεν επηρεάζεται. Έχει χαθεί μόνο ένα βιτρό του ναού, το οποίο αντικαταστάθηκε από το 2000 σε ένα νέο, που δημιουργήθηκε από τον αρχιτέκτονα Хансом-τον γκότφριντ φον Штокхаузеном.